CRISPR Screening的应用


问题:

  • 基本原理
  • 实际应用

GWAS是在大自然的数据中去筛选疾病associated genes

CRISPR Screening则是在人为的库里筛选疾病associated genes

分析:

  • GWAS的最大用途就是大数据,样本量上去了就很好搞,但现在几乎很难搞到大数据了,已经被瓜分得差不多了,就算你有钱也搞不到,样本受医生的控制,适合关系党;
  • CRISPR Screening不受限制,有钱就能筛,有一点的实验设计门槛,适合技术党;

核心的原理就是通过对比,找到表型关联基因,非常直接。

研究范文:

  • CRISPR Screens Identify Essential Cell Growth Mediators in BRAF Inhibitor-resistant Melanoma - 2020
  • 2021. In vivo CRISPR screens identify the E3 ligase Cop1 as a modulator of macrophage infiltration and cancer immunotherapy target. Cell

参考:

  • 精准大海捞针--CRISPR screening专题