使用nnUNet在自己的数据集上训练出现的问题

错误一

在使用代码nnUNet_plan_and_preprocess -t XXX --verify_dataset_integrity进行数据集验证时出现AssertionError

AssertionError: could not find label file for case MR_001_0000. Expected file: /data/nnUNet_raw_data_base/nnUNet_raw_data/Task066_MR/labelsTr/MR_001_0000.nii.gz

数据集已经按照要求的情况下（image，label）->（MR_001_0000.nii.gz，MR_001.nii.gz）
错误产生原因：在json文件中images不需要加上模态："image": "./imagesTr/MR_001.nii.gz"而不是"image": "./imagesTr/MR_001_0000.nii.gz"
并且所有数据必须都有在json文件中写入的模态。

错误二

在使用代码nnUNet_plan_and_preprocess -t XXX --verify_dataset_integrity进行数据集验证时出现nibabel.filebasedimages.ImageFileError
nibabel.filebasedimages.ImageFileError: Cannot work out file type of ".../nnUNet_raw/nnUNet_raw_data/Task066_LiverMriTumour/imagesTr/MR_001_0000.nii.gz"
错误原因：尽管文件扩展名为GZ，但该文件实际上可能并未压缩。尝试用gzipping压缩它

错误三

在使用代码nnUNet_plan_and_preprocess -t XXX --verify_dataset_integrity进行数据集验证时出现出现某些数据维度不匹配
将不匹配数据删除即可（image、label、json中都要删除）

错误四

Could not find a task with the ID xx
错误原因：双位数的ID，前面要补0，66要变成066