非root用户安装科学计算包blas、lapack和FFTW


一、安装FFTW

1、下载安装包

下载地址:http://www.fftw.org/download.html 

 2、编译安装

tar -zxvf fftw-3.3.10.tar.gz
cd fftw-3.3.10/
./configure --prefix=/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/fftw --enable-threads
make
make install  

 3、测试例子

g++ test_fftw.cpp -o test_fftw -lfftw3 \ 
-L/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/fftw/lib \ 
-I/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/fftw/include
-L和-I后为我们指定软件的安装路径的lib文件夹和include文件夹

一、安装blas、lapack

1、环境准备

依赖库至少需要 gfortran、cmake。其他不能确定

2、下载lapack安装包

下载地址:https://www.netlib.org/lapack/ 
lapack包里已经包含了blas包了,无需重新下载】

3、解压编译安装

tar -zxvf lapack-3.10.0.tar.gz
cd lapack-3.10.0/
解压之后它里面会含有BLAS,CBLAS,LAPACKE等文件夹,其中BLAS是BLAS的源码,CBLAS是BLAS的C语言接口
make之前,需要先创建一个make.inc文件,可以直接根据make.inc.example创建
cp make.inc.example make.inc
1、修改Makefile文件
如果是使用gfortran,则无须更改make.inc里的内容,否则需要根据系统环境和编译器修改文件里对应的选项。
LAPACK依赖BLAS,因此在编译LAPACK前需要提供BLAS包,所幸LAPACK里已经集成了BLAS包,但默认并不编译它。
要想编译LAPACK前先编译BLAS,需要修改一下makefile: 
vim Makefile

 然后make编译
2、cd LAPACKE目录下,再次进行make操作!~【重要】
两处都make成功后,会在目录lapack-3.10.0下生成 liblapack.a、liblapacke.a、librefblas.a、libtmglib.a 这个4个静态库文件

把这4个静态库文件,拷贝到/usr/local/lib/目录下(非root用户拷贝到自己创建目录下)
cp *.a /BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/usr/local/lib/
lapack目录下的include里的头文件拷贝到/usr/local/include/目录下(非root用户拷贝到自己创建目录下)
cd LAPACKE/include
cp *.h /BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/usr/local/include/

至此lapack 和 blas已经安装好了!

4、测试lapack和blas包是否安装成功

测试代码(test.c)放在最后面
使用软连接进行编译
gcc test.c -o test -I/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/usr/local/include -L/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/usr/local/lib -llapacke -llapack -lrefblas -lgfortran -lm -w
执行./test
 

三、测试的代码

1、FFTW的测试代码

ds

2、blas、lapack的测试代码

vim test.c

#include 
#include 
int main (int argc, const char * argv[])
{
  double a[5*3] = {1,2,3,4,5,1,3,5,2,4,1,4,2,5,3};
  double b[5*2] = {-10,12,14,16,18,-3,14,12,16,16};
  lapack_int info,m,n,lda,ldb,nrhs;
  int i,j;

  m = 5;
  n = 3;
  nrhs = 2;
  lda = 5;
  ldb = 5;

  info = LAPACKE_dgels(LAPACK_COL_MAJOR,'N',m,n,nrhs,a,lda,b,ldb);

  for(i=0;i