非root用户安装科学计算包blas、lapack和FFTW
一、安装FFTW
1、下载安装包
下载地址:http://www.fftw.org/download.html2、编译安装
tar -zxvf fftw-3.3.10.tar.gz cd fftw-3.3.10/ ./configure --prefix=/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/fftw --enable-threads make make install
3、测试例子
g++ test_fftw.cpp -o test_fftw -lfftw3 \ -L/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/fftw/lib \ -I/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/fftw/include-L和-I后为我们指定软件的安装路径的lib文件夹和include文件夹
一、安装blas、lapack
1、环境准备
依赖库至少需要 gfortran、cmake。其他不能确定2、下载lapack安装包
下载地址:https://www.netlib.org/lapack/
【lapack包里已经包含了blas包了,无需重新下载】
3、解压编译安装
tar -zxvf lapack-3.10.0.tar.gz cd lapack-3.10.0/解压之后它里面会含有BLAS,CBLAS,LAPACKE等文件夹,其中BLAS是BLAS的源码,CBLAS是BLAS的C语言接口
在make之前,需要先创建一个make.inc文件,可以直接根据make.inc.example创建
cp make.inc.example make.inc1、修改Makefile文件
如果是使用gfortran,则无须更改make.inc里的内容,否则需要根据系统环境和编译器修改文件里对应的选项。
LAPACK依赖BLAS,因此在编译LAPACK前需要提供BLAS包,所幸LAPACK里已经集成了BLAS包,但默认并不编译它。
要想编译LAPACK前先编译BLAS,需要修改一下makefile:
vim Makefile
然后make编译
2、cd LAPACKE目录下,再次进行make操作!~【重要】
两处都make成功后,会在目录lapack-3.10.0下生成 liblapack.a、liblapacke.a、librefblas.a、libtmglib.a 这个4个静态库文件
把这4个静态库文件,拷贝到/usr/local/lib/目录下(非root用户拷贝到自己创建目录下)
cp *.a /BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/usr/local/lib/把lapack目录下的include里的头文件拷贝到/usr/local/include/目录下(非root用户拷贝到自己创建目录下)
cd LAPACKE/include cp *.h /BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/usr/local/include/
至此lapack 和 blas已经安装好了!
4、测试lapack和blas包是否安装成功
测试代码(test.c)放在最后面使用软连接进行编译
gcc test.c -o test -I/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/usr/local/include -L/BIGDATA2/nscc_sci_1/xujb/usr/local/lib -llapacke -llapack -lrefblas -lgfortran -lm -w
执行./test
三、测试的代码
1、FFTW的测试代码
ds
2、blas、lapack的测试代码
vim test.c
#include
#include
int main (int argc, const char * argv[])
{
double a[5*3] = {1,2,3,4,5,1,3,5,2,4,1,4,2,5,3};
double b[5*2] = {-10,12,14,16,18,-3,14,12,16,16};
lapack_int info,m,n,lda,ldb,nrhs;
int i,j;
m = 5;
n = 3;
nrhs = 2;
lda = 5;
ldb = 5;
info = LAPACKE_dgels(LAPACK_COL_MAJOR,'N',m,n,nrhs,a,lda,b,ldb);
for(i=0;i