基础医学实验设计 | 控制变量法
重点关注基础医学的实验设计:GWAS、疾病的分子机理的研究。
目前主流的实验设计:
- 一切都是从现有的病人数据开始,找mutation、variant;
- 针对某个特定的对象:variant、mutation、gene,构建基础模型来研究
基础概念:
- 病人是非常复杂的实例,他们这是根据表型的观测来归类的,核心的是利用大样本的相关性把高风险的factor给鉴定出来了
- 研究单个病人是没有意义的,因为这是个个例,而且混杂的因素太多,由于伦理问题,很多invasive的实验都做不了
- 所以构建其他模型来研究病人来源的factor就是目前的绝对主流了,更容易临川转化
很多人都会怼,都什么时代了,大家都知道分子调控是一个分子网络,研究单个基因还有什么卵用。
那我们再反问一下,除了一个一个的构建model来研究,我们还有其他办法吗?我们真能根据一个病人的多组学测序数据来直接做出全面的解释吗?
No,我们对复杂系统的控制能力还非常弱,这些看似笨傻的GWAS和单基因敲出实验是我们目前唯一能熟练掌握的技术了。
GWAS的关联分析,多么elegant的筛选,直觉就能理解;
控制变量法的单基因敲除实验,探索和解释起来也能完全掌控;
我们清楚的知道,在数学中,每增加一个变量,其计算量可以说是几何倍数的增加。在我们进行许多研究的时候,都要通过整齐化制造一个对结果有利的环境。这种手段,是受限于人类的思考能力,使用的简化问题的手段。但是这是否阻挡了所谓科学的进步?有许多基于系统性的问题,有大量的因素和相互作用关系。一旦我们采用控制变量的手段,往往会导致问题本身的混乱,甚至是不可解。在一个复杂的系统中更是如此,如果只是追根溯源,采用针对问题本身的调节,又会出现连续的复杂的隐患。如此,如何判断问题?控制变量的方式本身,是否不符合世界的更复杂的问题?
参考:
- 控制变量法是否限制了科学的进步?